Minden év legalább egy szer (szezon elején vagy végén) az egész csepegtető rendszer kellene tisztítani. Ez például a következő módon lehet:
1- az egész rendszer egy savas oldattal tölteni (salétromsav, pH 2-3)
Szükséges salétromsav mennyiség: 2-3 l/100 l. (pH 2,5 kb. de tessék ellenőrizni, hogy a rendszer bírja ilyen alacsony pH)
Az rendszer kb 24 órán át így tartani.
Azután minden végdugó levenni és az oldat tiszta vízzel kinyomatni. Elég sok lerakodás lehet a rendszerben, azért fontos hogy az nem a csepegtetőnyilásokon keresztül mennyen ki, mert eldugulhat a csepegtetőszalag – tüskék.
2- Egy új oldat készíteni és azt kicsepegtetni. Az pld Salétromsavval lehet. A pH megint kb 2,5 kel hogy legyen. Ezzel legalább 10 perc csepegtetni. Tessék ellenőrizni, hogy mindenhol csepeg a rendszer.
3- Tiszta vízzel a rendszer jó megmosni.